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陸域植物
東沙島是由珊瑚及貝類等生物碎屑堆積組成，為許多熱帶植物分布的北界。島上植物，大多為泛熱帶性的種類，其中原生植物中之白避霜花、橙花破布子及海人樹等在台灣無分布記錄。草海桐是島上分布最廣的灌叢。
白避霜花
有大型葉片，白色樹皮光滑，小型花朵聚生，可抵抗寒霜而不凋落，所以稱為「白避霜花」。材質輕軟易腐，昔日主要做為薪炭之用，栽植在海邊堤岸可以防風防潮，其棍棒狀的核果表面有刺狀黏性腺體，可黏附於鳥族羽毛借力傳播。
海人樹
熱帶海島的先鋒樹種，生長於沙地或珊瑚礁上，常見於太平洋至印度洋熱帶地區包括太平島，臺灣地區則因地處分布邊界，所以沒有它的蹤跡。
橙花破布子
臺灣鄉間常有人種破布子，因果實可以醃製成佐菜。橙花破布子是破布子的近親，但橙花破布子的花大得多，而且是鮮豔的橘紅色；果實也大，加上為了適應海漂的環境需求，因此具有木栓質的中果皮，而且還受到增大的宿存花萼完全地包覆，讓它可以長時間在海中漂浮，完全不需要擔心種子受到威脅。
草海桐
總是喜歡倚在珊瑚礁岸或是與其他濱海植物聚生於海邊，最引人注目的是似乎被削去一半的花，花瓣半圓形朝下，裂成五片，彷彿只有半朵。草海桐的枝葉常保青翠，美觀且能防風定沙，是海邊廣為栽植的樹種，此外草海桐的葉和果都能食用，是救命野菜，但據說風味欠佳。
匍地垂桉草
主要分布於南洋地區或更南方，臺灣未曾發現，所以我們可以大膽地推測東沙島應該就是匍地垂桉草分布的北界。此草耐鹽性高，可作為防風定沙的綠化植物，植株有治毒蛇咬傷、感冒風熱的藥效。
老虎心
主要出現在海邊，東沙島上目前僅見一棵。全株帶刺，不易親近，是臺灣原生植物，本來濱海地區數量不少，大概滿身是刺阻礙通行，看來也沒什麼用處，因此難逃遭到砍除消失殆盡的命運，以至於名列瀕臨絕種的植物清單。在臺灣除了蘭嶼和曾文溪口，就只在東沙島和南沙太平島有零星分布。
